Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms