Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms