Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Krt77Q6IFZ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Krt77Q6IFZ6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Krt77Q6IFZ6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Krt77Q6IFZ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Krt77Q6IFZ6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt77Q6IFZ6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms