Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg9bQ6EBV9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms