Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lemd2Q6DVA0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lemd2Q6DVA0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lemd2Q6DVA0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lemd2Q6DVA0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms