Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca2Q6DIC0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms