Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms