Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6DFW0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6DFW0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms