Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms