Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp7Q6A4J8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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