Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Pdzrn3Q69ZS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Pdzrn3Q69ZS0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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