Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms