Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prex1Q69ZK0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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