Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp9bQ66X22 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms