Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tpgs2Q66JT5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tpgs2Q66JT5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tpgs2Q66JT5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs2Q66JT5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms