Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms