Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn13Q64512 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn13Q64512 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms