Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms