Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms