Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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