Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms