Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd33Q63994 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms