Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Znf260Q62513 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf260Q62513 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms