Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms