Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms