Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ndufa4Q62425 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ndufa4Q62425 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms