Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa13Q62424 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms