Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt6hQ62383 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Supt6hQ62383 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Supt6hQ62383 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt6hQ62383 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms