Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall3Q62255 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall3Q62255 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall3Q62255 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms