Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms