Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms