Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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