Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms