Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rai1Q61818 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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