Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms