Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms