Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc6Q61143 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Trpc6Q61143 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Trpc6Q61143 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Trpc6Q61143 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc6Q61143 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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