Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms