Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sim1Q61045 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms