Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd6Q61003 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms