Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms