Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ripk1Q60855 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ripk1Q60855 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ripk1Q60855 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ripk1Q60855 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ripk1Q60855 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ripk1Q60855 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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