Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samhd1Q60710 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms