Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CttnQ60598 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms