Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms