Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms