Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms