Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttf2Q5NC05 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf2Q5NC05 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms