Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3558Q5FWC9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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