Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms